"YoRHa: Протокол высадки в Перл-Гарбор. Том 1" запускает эпическую сагу в рамках вселенной NieR: Automata, рассказывая об отчаянной борьбе человечества против инопланетного вторжения. Люди, вынужденные покинуть Землю и приют на Луне, создают армию боевых андроидов, среди которых отличаются женщины-андроиды из отряда YoRHa. Эти боевые машины должны стать решающим фактором в войне, изменить ход конфликта и отвоевать планету для возвращения человечества.
11941 год нашей эры становится решающим моментом в долговременной войне. Встреча с машинными формами жизни, высвобожденными инопланетными захватчиками, вызывает ряд проблем и моральных дилемм для андроидов YoRHa, разработанных и запрограммированных только для боя.
Этот том также размышляет о судьбе и будущем андроидов, которые борются не за собственное существование, а за будущее человеческой расы, сомневая их место и значение в этой борьбе. Смогут ли они найти свой путь и настоящую цель за пределами боя, который они ведут?